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TruSeq 接头中独特分子标识符的整合提高了定量测序的精确性

阅读人数:975 发布时间:2017/12/25 9:11:56

 
 
二代测序数据的定量分析要求区分重复读长,重复读长在PCR过程中由具有独特起源的相同分子产生。通常PCR复制被定义为序列读取,它以对齐为依据,对齐到相同的基因组坐标上。然而,在文库构建期间,相同的分子能够独立产生。作为PCR的复制品,分析时这些分子的错误识别能够产生不可预见的偏爱。美国纽约大学科学家开发了一种性价比高的序列接头,通过改进Illumina公司TruSeq接头,结合独特分子标识符(UMI)的设计,可以维持进行多重、单一指标测序的能力。UMIs结合到TruSeq接头(即TrUMIseq 接头)能够识别真正的PCR产物,这些PCR产物带有相同UMIs作为相同的图谱读取。使用TrUMIseq 接头,在使用DNA测序的各种人群中和使用RNA测序的基因表达定量中, PCR复制品的精确移除提高了等位基因频率估计的精确度和RNA测序基因表达定量。
 
原文:
Jungeui Hong BioTechniques 63:221-226 (November 2017)and David Gresham. Incorporation of unique molecular identifiers in TruSeq adapters improves the accuracy of quantitative sequencing.

原创作者:北京鼎国昌盛

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